惠文高中普通班課程設計多元創新，注重學生的全面發展。高一開設多元選修，每學期22門課供學生自選，鼓勵適性探索。同時，高一學生必修第二外語，可選擇日語、德語、西語或法語，培養多語能力。

高二設立校訂必修「專題研究與實作」，14門課程供選，旨在培養學生的問題探討和解決能力。高三則提供多元選修，分兩組共12門課程，幫助學生順利銜接大學學習。

學校特別重視自主學習能力的培養。高一、高二每學期安排自主學習時間，並設立課程諮詢中心，編製自主學習引導手冊，協助學生規劃和完成個人學習計劃，為未來的學習和發展奠定基礎。
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惠文高中體育班採特色招生甄選入學方式，旨在選拔優秀運動人才。課程設計方面，任課教師以主題教學方式授課，讓學生學習各科目的基本實用能力。

為了兼顧運動訓練和學業發展，學校設立了專用自主學習教室，搭配課後學習輔導方案，教師在此進行課業輔導，幫助體育生解決學習上的困難。

體育班的教育目標是培養運動和學業均衡發展的學生。通過專業的運動訓練和針對性的學科輔導，幫助學生在體育競技和學業成績上都能取得良好表現。
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惠文高中的國際教育實驗班是學校特色課程的重要一環，旨在培養具有全球視野的未來領袖。本校以國際教育為發展主軸，精心設計課程體系，協助學生進行國際化的生涯規劃，並著力提升其國際行動力。

課程設計上，增加第二外語的學分數及英文課程全英授課，涵蓋聽說讀寫全方位訓練，提升學生的語言能力，使其能夠在國際舞台上自信表達。同時，配合國際交流活動，讓學生深入了解不同國家的風俗民情，培養跨文化溝通能力。

為確保學習成效，學校並積極輔導學生參加各種國際認可的外語檢定，如托福、雅思等，為學生的國際學習之路鋪平道路。此外，通過與海外學校的交流項目，學生有機會親身體驗國際教育環境，為未來銜接各國高等教育體制做好充分準備。
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